图标：肿瘤的分子流行病学与早期干预系统研究
描述：在全市范围开展以人群为基础的病因流行病学研究，为肿瘤高危人群的筛检和预防控制提供科学根据。
图标：肿瘤生物学起源、肿瘤演进、肿瘤调控机制系统性研究
描述：基因组学测序以及生物信息学全景遗传学分析，更早地发现、预测肿瘤行为，为患者提供精准诊治。
图标：个体化综合治疗研究。肿瘤临床转化研究
描述：巧用人工智能搭建基础研究和先进制造业的桥梁，加速集成创新转化应用，探索肿瘤诊疗新策略 。
| 论文名称 | 作者 | 期刊 |
|---|---|---|
| Whole-exome and targeted gene sequencing of gallbladder carcinoma identifies recurrent mutations in the ErbB pathway | Maolan Li, Zhou Zhang Xiaoguang Li, etc. | Nature Genetics |
| Genomic ERBB2/ERBB3 mutations promote PD-L1- mediated immune escape in gallbladder cancer: a whole-exome sequencing analysis | Maolan li, Fatao liu,Fei Zhang, etc. | Gut |
| Dual inhibition of CDK4/6 and XPO1 induces senescence with acquired vulnerability to CRBN-based PROTAC drugs | Wang H, Yuan S, Zheng Q, etc. | Gastroenterology |
| Tumor cellintrinsic epigenetic dysregulation shapes CAF heterogeneity to metabolically support pancreatic cancer | Niu NN, Shen XQ, Wang Z C,etc. | Cancer Cell |
| Spatiotemporal role of SETD2-H3K36me3 in murine pancreatic organogenesis | Lu P, Xu JY, Shen XQ, etc. | Cell Reports |
| Tumor cell-intrinsic SETD2 deficiency reprograms neutrophils to foster immune escape in pancreatic tumorigenesis | Niu NN, Shen XQ, Zhang L, etc. | Advanced Science |
| Aggregation-enabled alkene insertion into carbon–halogen bonds | Meng-Yao Li, Xiao-Mei Nong, Han Xiao, etc. | Aggregate |
| Topological reorganization and functional alteration of distinct genomic components in gallbladder cancer | Guoqiang Li, Peng Pu, Mengqiao Pan, etc. | Frontiers of Medicine |
| Structural basis for product specificities of MLL family methyltransferases | Yanjing Li, Lijie Zhao, Yuebin Zhang, etc. | Molecular Cell |
| The engagement of histone lysine methyltransferases with nucleosomes: structural basis, regulatory mechanisms, and therapeutic implications | Yanjing Li*, Kexue Ge, Tingting Li, etc. | Protein & Cell |
| Structure of scavenger receptor SCARF1 and its interaction with lipoproteins | Wang Y, Xu F, Li G, etc. | eLife |
| Interaction of human dendritic cell receptor DEC205/CD205 with keratins | Kong D, Qian Y, Yu B, etc. | J Biol Chem |
| Long-term exposure to genistein inhibits the proliferation of gallbladder cancer by downregulating the MCM complex | Yajun Geng, Shili Chen, Yang Yang, etc. | Science Bulletin |
| Single-cell RNA-sequencing atlas reveals an MDK-dependent immunosuppressive environment in ErbB pathway-mutated gallbladder cancer | Yijian Zhang, Chunman Zuo, Liguo Liu, etc. | Journal of Hepatology |
| Whole-exome mutational landscape of neuroendocrine carcinomas of the gallbladder | Fatao Liu, Yongsheng Li, Dongjian Ying, etc. | Signal Transduction and Targeted Therapy |
| Regulation of BMP2K in AP2M1-mediated EGFR internalization during the development of gallbladder cancer. | Xiaoling Song, Maolan Li, Wenguang Wu, etc. | Signal Transduction and Targeted Therapy |
| A DNA/upconversion nanoparticle complex enables controlled co-delivery of CRISPER-Cas9 and photodynamic agents for synergistic cancer therapy. Advanced Materials. | Nachuan Song, Xiaoting Fan, Xiaocui Guo, etc. | Advanced Materials |
| DNA nanoclusters combined with one‐shot radiotherapy augment cancer immunotherapy efficiency | Yuexia Xie, Huishan Li, Lei Xu, etc. | Advanced Materials |
| A DNA/DMXAA/metal‐organic framework activator of innate immunity for boosting anticancer immunity. | Xiaojing Chen, Qianyun Tang, Jinqiang Wang, etc. | Advanced Materials |
| Integrated DNA and RNA sequencing reveals early drivers involved in metastasis of gastric cancer | Jieyun Zhang, Fatao Liu, Yanan Yang, etc. | Cell death and disease |
| Advances in immunotherapy for biliary tract cancers | Yuhao Zhao , Mao Yang, Jiayi Feng, etc. | Chinese Medical Journal |
| YKL-40 derived from infiltrating macrophages cooperates with GDF15 to establish an immune suppressive microenvironment in gallbladder cancer. | Ziyi Wang, Shijia Wang, Ziheng Jia, etc. | Cancer Letter |
重点实验室已建立起一支科研人员、临床医生和生物医学产业人员相结合的科研队伍。面向肿瘤的分子流行病学与早期干预，肿瘤生物学起源、肿瘤演进、肿瘤调控机制，肿瘤临床转化研究三个方向进行重点攻坚。目前在研项目有35项，其中国家级重点项目3项，国家级项目18项，省部级项目10余项，经费2500余万元
| 项目名称 | 项目负责人 | 等级 | 经费来源 |
|---|---|---|---|
| 基于组学的胆道恶性肿瘤分子免疫全景解析 | 刘颖斌 | 国家级 | 基金委重点 |
| 胆道恶性肿瘤微环境中免疫细胞分子特征及免疫治疗临床决策模型构建 | 李茂岚 | 国家级 | 科技部国家重点研发 |
| 糖脂代谢中清道夫受体的结构与分子机制研究 | 何勇宁 | 国家级 | 基金委重大研究 |
| 细胞粘附原位结构的电子断层成像研究 | 何勇宁 | 国家级 | 基金委专项 |
| 胰腺肿瘤病理机制研究 | 薛婧 | 国家级 | 优秀青年基金项目 |
| 单核/巨噬细胞中 H3K36me3 组蛋白修饰 调控急性胰腺炎进展的作用机制研究 | 薛婧 | 国家级 | 基金委面上 |
| 细胞表面受体原位结构的电子显微学研究 | 何勇宁 | 国家级 | 基金委面上 |
| 肿瘤细胞核酸分子精准调控核酸纳米药物高效发挥免疫/化疗协同效应治疗食管癌 | 刘培峰 | 国家级 | 基金委面上 |
| TNIP2突变体（TNIP2-T111I）与TEK相互作用在胆囊癌淋巴转移中的作用及调控机制研究 | 李茂岚 | 国家级 | 基金委面上 |
| ERBB2/ERBB3功能异常诱导内皮细胞失稳态及其调控胆囊癌免疫逃逸的机制研究 | 向冬喜 | 国家级 | 基金委面上 |
| ERo1 a协同KRAS促进胰腺炎癌转化的机制研究 | 花荣 | 国家级 | 基金委面上 |
| 染色体外环状DNA驱动癌基因组重塑调控GPX4及线粒体自噬促进胆囊癌化疗耐药的机制研究 | 王辉 | 国家级 | 基金委面上 |
| 脆弱拟杆菌感染的胆囊癌细胞源性外泌体lncRNA APTR促进胆囊癌免疫逃逸的作用机制研究 | 吴文广 | 国家级 | 基金委面上 |
| S-equol长期暴露通过上调DUSPs表达逆转ErbB通路突变胆囊癌免疫逃逸的机制研究 | 耿亚军 | 国家级 | 基金委面上 |
| 基于机器学习、靶向前列腺癌miRNA标签的核酸药物设计及其递送治疗研究 | 许航 | 国家级 | 基金青年 |
| NNMT高表达促胆囊癌M2型TAM聚集及免疫逃逸的机制研究 | 李洋 | 国家级 | 基金青年 |
| 探究胰腺癌NGFR+成纤维细胞亚群对肿瘤恶性进展的影响及潜在作用机制 | 齐晶晶 | 国家级 | 基金青年 |
| 趋化因子CXCL10介导CD8+T细胞耗竭促进ErbB通路突变胆囊癌免疫逃逸的作用及机制研究 | 刘立果 | 国家级 | 基金青年 |
| 胆道肿瘤分⼦特征谱及系统功能组学研究 | 刘颖斌 | 省部级 | 市科委 |
| 基于新媒体平台的胰腺恶性肿瘤科普短视频创制与推广项目 | 孙勇伟 | 省部级 | 市科委 |
| 具有声热/免疫效应的DNA-金属有机框架纳米药物构建及抗乳腺癌治疗 | 刘培峰 | 省部级 | 市科委 |
| 胆道肿瘤类器官构建及其对肿瘤免疫治疗效果的评估 | 向冬喜 | 国家级 | 市科委科技创新行动计划 |
| 胆囊癌中“二次打击”突变促进肿瘤发展的功能学验证及免疫学机制探索 | 刘法涛 | 省部级 | 市科委启明星 |
| MLL家族甲基转移酶在肿瘤发生发展中的机制探究 | 黎彦璟 | 省部级 | 市科委启明星 |
| 单细胞多组学解析胆囊癌肿瘤微环境及免疫代谢治疗新靶标开发 | 赵朝贤 | 省部级 | 市科委浦江人才 |
| 肿瘤的表观遗传调控与精准治疗 | 黎彦璟 | 省部级 | 市组织部东方英才 |
| 基于液体活检技术对胆道恶性肿瘤精准诊疗的研究及应用推广 | 刘颖斌 | 局级 | 申康发展中心 |
| 磁性DNA纳米凝胶逻辑门控精准释药治疗肿瘤 | 刘培峰 | 局级 | 卫生健康委员会新兴交叉领域研究专项 |
| 基于组学的胆囊癌分子免疫全景解析 | 刘赟 | 局级 | 卫健委面上 |
| BAP1基因胚系突变胆囊癌患者“靶向+免疫”联合治疗的生物学基础探索 | 刘法涛 | 局级 | 卫健委青年人才 |
| 改良FOLFIRINOX方案联合信迪利单抗治疗晚期胆道恶性肿瘤的随机对照研究 | 李茂岚 | 局级 | 上海市卫生健康委员会 |
| iPSC诱导分化血管内皮类器官模型构建及其在免疫治疗疗效评估中的应用 | 刘颖斌 | 校级 | 上海交通大学各类基金 |
| 液体活检技术监测下阿法替尼治疗 ErbB 通路突变型胆囊癌患者的研究 | 刘赟 | 校级 | 上海交通大学“交大之星”计划医工交叉研究基金 |
| DNA-螺烯纳米药物发挥免疫/靶向杀伤协同效应高效治疗肾癌 | 刘培峰 | 校级 | 上海交通大学“交大之星”计划医工交叉研究基金 |
| ctDNA突变及甲基化检测在胆囊癌复发与转移中的应用研究 | 刘赟 | 横向 | 上海润达榕嘉生物科技有限公司 |